เชื้อโรคจะเข้าไปอยู่ในลำไส้เล็กและทำให้เกิดการอักเสบและบวมลำไส้อักเสบอาจเกิดจาก:ภาวะภูมิคุ้มกันทำลายตนเอง เช่นโรคโค รห์นยาบางชนิด รวมทั้ง NSAIDS (เช่น ไอบูโพรเฟนและนาพรอกเซนโซเดียม) และโคเคนความเสียหายจากการักษาด้วยรังสีโรคช่องท้องป่วงเขตร้อนโรควิปเปิ้ลการอักเสบอาจเกี่ยวข้องกับกระเพาะอาหาร ( โรคกระเพาะ ) และลำไส้ใหญ่ ( ลำไส้ใหญ่อักเสบ )ปัจจัยเสี่ยงได้แก่:ไข้หวัดลงกระเพาะล่าสุดของสมาชิกในครัวเรือนการเดินทางล่าสุดการสัมผัสกับน้ำที่ไม่สะอาดประเภทของ ลำไส้อักเสบ ได้แก่ :กระเพาะและลำไส้อักเสบจากแบคทีเรียลำไส้อักเสบจากเชื้อ Campylobacterลำไส้อักเสบจากเชื้ออีโคไลอาหารเป็นพิษลำไส้อักเสบจากรังสีลำไส้อักเสบจากเชื้อซัลโมเนลลาโรคลำไส้อักเสบจากเชื้อชิเกลล่าโรคอาหารเป็นพิษจากเชื้อ Staph aureus